La gobernanza de ERETES es desempeñada a través de dos órganos:
El comité directivo reúne a los representantes de los copropietarios (Eurostat e INSEE), el IBGE (Brasil) actuando en nombre de los responsables de los INS que utilizan ERETES, Afristat como la agencia responsable de la implementación de ERETES en sus Estados miembros, el presidente del grupo ERETES. Este comité proporciona dirección estratégica y toma decisiones sobre el futuro de ERETES.
El comité técnico reúne a los dos contables nacionales de la División Apoya Técnico Internacional del INSEE trabajando a tiempo completo en la herramienta, el responsable del seguimiento de ERETES dentro de la unidad de cooperación de EUROSTAT, a los contables nacionales de AFRISTAT y al presidente del grupo ERETES. Este comité asume la respuesta a los usuarios a través de una hotline dedicada, maneja las relaciones con el proveedor de servicios informáticos responsable del mantenimiento y propone mejoras y nuevos desarrollos al comité directivo.